Sau 9 năm thành lập, trường ĐHQT đã hình thành các nhóm nghiên cứu mạnh nhằm củng cố, tăng cường và đa dạng hóa các loại hình nghiên cứu. Hiện tại số bài báo quốc tế thuộc hệ thống ISI ở các lĩnh vực Toán, Lý, Công nghệ Sinh học, Kỹ thuật Y Sinh, Điện tử Viễn thông, Kỹ thuật Máy tính đã tăng dần, đạt tỉ lệ số bài báo quốc tế/giảng viên là 0,77. Số lượng, cấp độ và kinh phí đề tài đã tăng mạnh. Năm 2010, kinh phí NCKH đạt gần 5 tỉ đồng. Đặc biệt, trường đã chú trọng hướng nghiên cứu ứng dụng về Điều khiển giao thông bằng hệ thống viễn thông, thiết lập hệ thống quản lý ô nhiễm môi trường nước, nghiên cứu biến đổi khí hậu,…nhằm giải quyết kịp thời các vấn đề cấp bách của xã hội, phát triển kinh tế của địa phương và cả nước.